対処方法
Macでアプリケーションを更新したり（Atomエディタの更新で現象が出ました）、インストール/アンインストールすると削除したはずの古いバージョンのアプリがリストに表示されたりする場合があります。
最初はほったらかしてたのですが、徐々に増えてきてさすがにうっとうしくなってきたので整理しようと調べました。
ターミナルを起動して以下のコマンドを実行するとリストがきれいに整理されます。
$ /System/Library/Frameworks/CoreServices.framework/Versions/A/Frameworks/LaunchServices.framework/Versions/A/Support/lsregister -kill -r -domain local -domain user $ killall Finder
参考サイト：
「このアプリケーションで開く」の中身が重複している場合。 - Qiita
ファイルを右クリックしてから「このアプリケーションで開く」で、すでに削除済みのアプリや同じアプリが重複して表示されている場合、下記の対応で解消可能。ターミナルから$ /System/Librar…
qiita.com
How to clean "Open With" duplicates (Example)
A protip by xcerx about terminal, osx, and atom.
coderwall.com
